Sembra che abbia risolto attivando l'opzione Ingress shaping attivo:

Ho avuto un riavvio di ip, prima era 79.xx.xx.xxx ora invece 87.xx.xx.xxx ed non ho più il problema. Ora non so se ho fatto bene o meno ad attivarla, qualcuno riesce a spiegare cosa fa quest'opzione? Immagino dal nome che fa shaping sui pacchetti. È una cosa buona o no?
Ho provato poi a cappare il download e adesso funziona ma visto che anche senza cap non ci sono aumenti di latenza ho rimosso il limite
Edit: su utorrent il problema persiste