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francescofdd5 rsync o btrfs (rsync lo installi in mezzo secondo, btrfs è un filesystem, dunque dovrai smanettare un po') saranno i tuoi migliori amici.
Con rsync ti basta fare un backup completo e/o incrementale, poi lanci un semplice zip e ti sei risolto tutti i problemi, anche su file enormi.
Con btrfs invece ti levi totalmente il problema, se qualcosa fa storto puoi tornare indietro, senza il minimo problema.
Vedi questo video per saperne qualcosa in più: https://www.youtube.com/watch?v=04_f5iCk7e8